Namangan davlat universiteti
Annotatsiya. Oddiy va qoʻsh doking usullarida galantamin (G), dezoksipeganin (DOP) va L-askorbin kislotalarning (LAk) hamda G-DOP, G-LAK, DOP-LAK qoʻsh birikmalarining atsetilxolinesteraza (AXE) fermenti bilan ta’sirlashishi oʻrganildi. Qoʻsh doking tadqiqotlari natijasida galantamin molekulasining AXE faol markaziga kirmasligi ammo, dezoksipeganin alkaloidining yon birikmaning L-askorbin kislotasi yoki galantamin boʻlishidan qat’i nazar AXE faol markaziga kirib, faol markazdagi muhim amino kislotalar qoldiqlari bilan ta’sirlashishi kuzatildi. Ammo, G-LAK holatida L-askorbin kislotasi faol markazga chuqurroq kirib borib, katalitik triadaning SER203 amino kislota qoldigʻi bilan ta’sirlashishi aniqlandi. Olingan natijalar dezoksipeganin qoʻsh doking holatlarida galantaminga qaraganda faol markazga bogʻlanishga kuchliroq moyillikni namoyon etishi kuzatildi.
Kalit so'zlar: qoʻsh doking, atsetilxolinesteraza fermenti, galantamin, dezoksipeganin, L-askorbin kislotasi, AutoDock Vina
Аннотация. Взаимодействие галантамина (G), дезоксипеганина (DOP) и L-аскорбиновой кислоты (LAK), а также бинарных комплексов G–DOP, G–LAK и DOP–LAK с ацетилхолинэстеразой (АХЭ) было исследовано с использованием методов молекулярного докинга с одним и двумя лигандами. Результаты двойного докинга показали, что галантамин не проникает в активный центр АХЭ. В отличие от него, дезоксипеганин смог получить доступ к активному центру и взаимодействовать с ключевыми аминокислотными остатками независимо от того, был ли сопутствующий лиганд L-аскорбиновой кислотой или галантамином. Кроме того, в комплексе G–LAK L-аскорбиновая кислота проникла глубже в активный центр и образовала взаимодействия с Ser203, ключевым остатком каталитической триады. Эти результаты свидетельствуют о том, что дезоксипеганин проявляет более сильную склонность к связыванию с активным центром, чем галантамин, в системах двойного докинга
Ключевые слова: двойной докинг, фермент ацетилхолинэстераза, галантамин, дезоксипеганин, L-аскорбиновая кислота, AutoDock Vina
Abstract. The interactions of galantamine (G), deoxypeganine (DOP), and L-ascorbic acid (LAK), as well as the binary compounds G–DOP, G–LAK, and DOP–LAK, with acetylcholinesterase (AChE) were investigated using both single- and double-ligand molecular docking approaches. The double-docking results revealed that galantamine does not penetrate the active site of AChE. In contrast, deoxypeganine was able to access the active site and interact with key amino acid residues regardless of whether the accompanying ligand was L-ascorbic acid or galantamine. Furthermore, in the G–LAK complex, L-ascorbic acid penetrated deeper into the active site and formed interactions with Ser203, a crucial residue of the catalytic triad. These findings suggest that deoxypeganine exhibits a stronger propensity for active-site binding than galantamine in dual-ligand docking systems
Keywords: double docking, acetylcholinesterase enzyme, galantamine, deoxypeganine, L-ascorbic acid, AutoDock Vina